Rutin dışkı incelemeleri ile amoebiosis tanısı konulamadığı hallerde rektoskopi ve kolonoskopi uygulaması ile alınan materyalin incelenmesi faydalı olabilir. Amoebiosis'in kesin tanısı kalın barsaktan alınan örneklerde Entamoeba histolytica'nın gösterilmesi ile konur. Ege Üniversitesi Gastroenteroloji kliniği parazitoloji lablatuvarına başvuran 157 amip şüpheli hastanın dışkı bakılarında parazit saptanamamıştır. Bu hastalardan elde edilen rektoskopi ve kolonoskopi materyallerinde inceleme yapılmış, 3 (%1.91) hastada Entamoeba histolytica trofozoitleri, 1 (%0.63) hastada ise Entamoeba coli trofozoitleri saptanmıştır.